单项选择题 ‏把两个以上字符序列对齐，逐列比较其字符的异同，使得每一列字符尽可能一致，以发现其共同的结构特征的方法称为（）。

单项选择题 ‎从头预测法从理论上为理想的方法，它要求方法本身可以只根据（）来预测蛋白质的二级结构和高级结构，但是现在的所有方法还不能完全达到这个要求。

单项选择题 基于知识的蛋白质的建模的方法包括（）和基于片段装配法，主要应用于loop及氨基酸侧链的建模。