背景
某机电安装公司承建一个生活小区室外热力管网工程安装任务。施工范围是由市政热力管网至各居民住宅楼号室外1m，管线是不通行地沟敷设。该项目的所有施工内容完毕，并与市政热力管网和各楼号热力管网接通后，在进行竣工验收的同时，项目经理部组织整理竣工资料与竣工图汇编工作如下：
1.收集的工程施工资料的情况包括：施工方案、技术交底及施工日志；管材、阀门和相关部件及绝热材料等物资进行检查检验记录、产品质量合格证；隐蔽工程检查记录，质量检查记录，压力试验记录；设计图纸和设计变更资料的收发记录等。
2.整理一套设计新图纸和设计变更资料并编绘成竣工图。
3.在施工资料整理检查时，发现：
（1）有两份物资进场检查记录使用了圆珠笔；
（2）一份隐蔽工程检查记录未经监理工程师确认签字，查施工日志记载：当时监理工程师到现场检查；
（3）其他各种资料内容齐全、有效；记录的编号齐全、有效。

在资料整理检查时，发现的（1）和（2）问题应如何处理？